Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF1BP20333 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF1BP20333 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF1BP20333 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms