Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMD1P17707 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMD1P17707 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMD1P17707 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMD1P17707 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMD1P17707 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMD1P17707 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMD1P17707 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AMD1P17707 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMD1P17707 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMD1P17707 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMD1P17707 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMD1P17707 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AMD1P17707 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AMD1P17707 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMD1P17707 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMD1P17707 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMD1P17707 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMD1P17707 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AMD1P17707 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMD1P17707 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMD1P17707 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMD1P17707 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMD1P17707 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMD1P17707 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMD1P17707 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AMD1P17707 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMD1P17707 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMD1P17707 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMD1P17707 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMD1P17707 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMD1P17707 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMD1P17707 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMD1P17707 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMD1P17707 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMD1P17707 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMD1P17707 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMD1P17707 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMD1P17707 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMD1P17707 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AMD1P17707 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AMD1P17707 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AMD1P17707 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AMD1P17707 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMD1P17707 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMD1P17707 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMD1P17707 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMD1P17707 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMD1P17707 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMD1P17707 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMD1P17707 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMD1P17707 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AMD1P17707 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMD1P17707 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMD1P17707 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMD1P17707 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMD1P17707 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMD1P17707 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMD1P17707 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMD1P17707 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMD1P17707 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms