Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GNB3P16520 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GNB3P16520 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GNB3P16520 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GNB3P16520 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GNB3P16520 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GNB3P16520 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GNB3P16520 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GNB3P16520 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GNB3P16520 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GNB3P16520 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GNB3P16520 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GNB3P16520 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GNB3P16520 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB3P16520 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB3P16520 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB3P16520 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB3P16520 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GNB3P16520 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB3P16520 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB3P16520 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB3P16520 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB3P16520 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB3P16520 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB3P16520 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB3P16520 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB3P16520 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GNB3P16520 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GNB3P16520 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB3P16520 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB3P16520 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB3P16520 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB3P16520 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB3P16520 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB3P16520 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB3P16520 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB3P16520 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB3P16520 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB3P16520 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GNB3P16520 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNB3P16520 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB3P16520 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB3P16520 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB3P16520 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB3P16520 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB3P16520 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB3P16520 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB3P16520 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB3P16520 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB3P16520 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GNB3P16520 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GNB3P16520 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GNB3P16520 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GNB3P16520 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNB3P16520 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB3P16520 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB3P16520 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNB3P16520 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms