Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTLA4P16410 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms