Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAG1P15918 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAG1P15918 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAG1P15918 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAG1P15918 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAG1P15918 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAG1P15918 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAG1P15918 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAG1P15918 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAG1P15918 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAG1P15918 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAG1P15918 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAG1P15918 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAG1P15918 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAG1P15918 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAG1P15918 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAG1P15918 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAG1P15918 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAG1P15918 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAG1P15918 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAG1P15918 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAG1P15918 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAG1P15918 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAG1P15918 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAG1P15918 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAG1P15918 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAG1P15918 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAG1P15918 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAG1P15918 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAG1P15918 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAG1P15918 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAG1P15918 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAG1P15918 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAG1P15918 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAG1P15918 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAG1P15918 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAG1P15918 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAG1P15918 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAG1P15918 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAG1P15918 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAG1P15918 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAG1P15918 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAG1P15918 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG1P15918 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG1P15918 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG1P15918 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG1P15918 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG1P15918 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG1P15918 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG1P15918 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG1P15918 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG1P15918 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG1P15918 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG1P15918 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAG1P15918 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAG1P15918 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAG1P15918 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAG1P15918 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAG1P15918 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAG1P15918 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAG1P15918 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAG1P15918 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAG1P15918 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAG1P15918 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAG1P15918 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG1P15918 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG1P15918 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms