Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GSPT1P15170 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GSPT1P15170 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSPT1P15170 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms