Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAFP15056 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAFP15056 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAFP15056 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAFP15056 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAFP15056 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAFP15056 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAFP15056 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAFP15056 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAFP15056 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAFP15056 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAFP15056 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAFP15056 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAFP15056 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAFP15056 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAFP15056 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAFP15056 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAFP15056 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAFP15056 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAFP15056 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAFP15056 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAFP15056 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAFP15056 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAFP15056 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAFP15056 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAFP15056 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAFP15056 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAFP15056 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAFP15056 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAFP15056 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAFP15056 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAFP15056 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAFP15056 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAFP15056 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAFP15056 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAFP15056 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAFP15056 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAFP15056 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAFP15056 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAFP15056 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAFP15056 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAFP15056 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAFP15056 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAFP15056 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAFP15056 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAFP15056 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAFP15056 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAFP15056 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAFP15056 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAFP15056 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAFP15056 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAFP15056 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAFP15056 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAFP15056 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAFP15056 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAFP15056 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAFP15056 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRAFP15056 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAFP15056 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAFP15056 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAFP15056 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAFP15056 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAFP15056 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAFP15056 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAFP15056 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAFP15056 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAFP15056 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAFP15056 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAFP15056 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAFP15056 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAFP15056 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAFP15056 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAFP15056 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAFP15056 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAFP15056 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAFP15056 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAFP15056 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAFP15056 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAFP15056 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAFP15056 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAFP15056 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAFP15056 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAFP15056 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAFP15056 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAFP15056 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAFP15056 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAFP15056 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAFP15056 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAFP15056 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms