Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB1P14653 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB1P14653 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB1P14653 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB1P14653 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB1P14653 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXB1P14653 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB1P14653 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms