Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT5P13647 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT5P13647 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT5P13647 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT5P13647 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT5P13647 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT5P13647 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT5P13647 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT5P13647 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT5P13647 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT5P13647 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT5P13647 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT5P13647 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT5P13647 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT5P13647 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT5P13647 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT5P13647 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT5P13647 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT5P13647 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT5P13647 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT5P13647 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT5P13647 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT5P13647 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT5P13647 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT5P13647 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT5P13647 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT5P13647 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT5P13647 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT5P13647 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT5P13647 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT5P13647 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT5P13647 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT5P13647 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT5P13647 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT5P13647 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT5P13647 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT5P13647 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT5P13647 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT5P13647 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT5P13647 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT5P13647 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT5P13647 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT5P13647 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT5P13647 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT5P13647 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT5P13647 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT5P13647 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT5P13647 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT5P13647 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT5P13647 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT5P13647 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT5P13647 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT5P13647 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT5P13647 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT5P13647 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT5P13647 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT5P13647 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT5P13647 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT5P13647 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT5P13647 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT5P13647 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT5P13647 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT5P13647 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT5P13647 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT5P13647 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT5P13647 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT5P13647 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT5P13647 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT5P13647 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT5P13647 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT5P13647 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT5P13647 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT5P13647 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT5P13647 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT5P13647 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT5P13647 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT5P13647 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT5P13647 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT5P13647 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT5P13647 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT5P13647 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT5P13647 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT5P13647 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT5P13647 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT5P13647 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT5P13647 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT5P13647 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT5P13647 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT5P13647 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT5P13647 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT5P13647 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT5P13647 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT5P13647 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT5P13647 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT5P13647 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT5P13647 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT5P13647 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT5P13647 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT5P13647 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT5P13647 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms