Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA4P13612 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA4P13612 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms