Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COX4I1P13073 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX4I1P13073 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms