Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL6A2P12110 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms