Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODC1P11926 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODC1P11926 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODC1P11926 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ODC1P11926 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODC1P11926 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODC1P11926 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODC1P11926 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODC1P11926 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODC1P11926 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODC1P11926 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODC1P11926 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODC1P11926 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODC1P11926 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ODC1P11926 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ODC1P11926 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ODC1P11926 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ODC1P11926 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ODC1P11926 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ODC1P11926 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ODC1P11926 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ODC1P11926 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ODC1P11926 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ODC1P11926 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ODC1P11926 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ODC1P11926 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ODC1P11926 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ODC1P11926 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ODC1P11926 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ODC1P11926 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ODC1P11926 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ODC1P11926 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ODC1P11926 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODC1P11926 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODC1P11926 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODC1P11926 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODC1P11926 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODC1P11926 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODC1P11926 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODC1P11926 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODC1P11926 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ODC1P11926 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODC1P11926 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODC1P11926 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODC1P11926 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODC1P11926 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODC1P11926 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ODC1P11926 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ODC1P11926 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ODC1P11926 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ODC1P11926 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ODC1P11926 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODC1P11926 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODC1P11926 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODC1P11926 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODC1P11926 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODC1P11926 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ODC1P11926 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ODC1P11926 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ODC1P11926 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODC1P11926 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODC1P11926 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODC1P11926 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODC1P11926 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODC1P11926 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODC1P11926 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ODC1P11926 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODC1P11926 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODC1P11926 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODC1P11926 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODC1P11926 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ODC1P11926 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ODC1P11926 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms