Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GNAT1P11488 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNAT1P11488 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms