Protein–RNA interactions for Protein: P10643

C7, Complement component C7, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7P10643 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C7P10643 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C7P10643 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C7P10643 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C7P10643 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C7P10643 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C7P10643 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C7P10643 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C7P10643 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C7P10643 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C7P10643 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C7P10643 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C7P10643 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C7P10643 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C7P10643 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C7P10643 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C7P10643 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C7P10643 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C7P10643 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C7P10643 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C7P10643 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C7P10643 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C7P10643 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C7P10643 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C7P10643 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C7P10643 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C7P10643 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C7P10643 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C7P10643 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C7P10643 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C7P10643 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C7P10643 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C7P10643 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C7P10643 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C7P10643 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C7P10643 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C7P10643 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C7P10643 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C7P10643 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C7P10643 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C7P10643 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C7P10643 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C7P10643 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C7P10643 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C7P10643 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C7P10643 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C7P10643 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C7P10643 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C7P10643 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C7P10643 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C7P10643 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C7P10643 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C7P10643 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C7P10643 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C7P10643 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C7P10643 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C7P10643 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C7P10643 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C7P10643 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C7P10643 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C7P10643 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C7P10643 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C7P10643 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C7P10643 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C7P10643 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C7P10643 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C7P10643 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C7P10643 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C7P10643 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C7P10643 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C7P10643 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C7P10643 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C7P10643 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C7P10643 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C7P10643 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C7P10643 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C7P10643 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C7P10643 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C7P10643 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C7P10643 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C7P10643 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C7P10643 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C7P10643 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C7P10643 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C7P10643 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C7P10643 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C7P10643 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C7P10643 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C7P10643 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms