Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMEM225BP0DP42 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM225BP0DP42 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms