Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN8OSP0DMR3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN8OSP0DMR3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATXN8OSP0DMR3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN8OSP0DMR3 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms