Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBBP0CG47 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms