Protein–RNA interactions for Protein: P0CG36

CFC1B, Cryptic family protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1BP0CG36 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFC1BP0CG36 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFC1BP0CG36 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFC1BP0CG36 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFC1BP0CG36 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFC1BP0CG36 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFC1BP0CG36 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFC1BP0CG36 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFC1BP0CG36 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1BP0CG36 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1BP0CG36 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1BP0CG36 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1BP0CG36 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFC1BP0CG36 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms