Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM228BP0C875 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM228BP0C875 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM228BP0C875 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM228BP0C875 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms