Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTAP09496 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTAP09496 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTAP09496 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTAP09496 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTAP09496 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTAP09496 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTAP09496 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTAP09496 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTAP09496 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTAP09496 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTAP09496 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTAP09496 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTAP09496 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTAP09496 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTAP09496 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTAP09496 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTAP09496 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTAP09496 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTAP09496 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTAP09496 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTAP09496 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTAP09496 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTAP09496 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTAP09496 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTAP09496 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTAP09496 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTAP09496 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTAP09496 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTAP09496 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLTAP09496 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLTAP09496 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTAP09496 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTAP09496 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTAP09496 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTAP09496 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTAP09496 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTAP09496 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTAP09496 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTAP09496 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLTAP09496 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTAP09496 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTAP09496 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTAP09496 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTAP09496 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTAP09496 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTAP09496 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTAP09496 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTAP09496 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTAP09496 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLTAP09496 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLTAP09496 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTAP09496 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTAP09496 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTAP09496 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTAP09496 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTAP09496 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTAP09496 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTAP09496 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTAP09496 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTAP09496 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTAP09496 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLTAP09496 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTAP09496 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTAP09496 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTAP09496 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTAP09496 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTAP09496 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTAP09496 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTAP09496 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTAP09496 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLTAP09496 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTAP09496 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTAP09496 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTAP09496 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTAP09496 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTAP09496 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTAP09496 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLTAP09496 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTAP09496 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTAP09496 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTAP09496 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTAP09496 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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