Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP3A4P08684 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP3A4P08684 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP3A4P08684 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms