Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRAP08240 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRAP08240 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms