Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSN3P07498 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSN3P07498 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSN3P07498 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSN3P07498 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSN3P07498 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSN3P07498 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CSN3P07498 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CSN3P07498 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSN3P07498 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSN3P07498 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN3P07498 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN3P07498 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN3P07498 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN3P07498 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN3P07498 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN3P07498 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN3P07498 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN3P07498 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN3P07498 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN3P07498 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN3P07498 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN3P07498 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN3P07498 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN3P07498 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSN3P07498 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSN3P07498 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSN3P07498 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSN3P07498 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSN3P07498 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSN3P07498 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSN3P07498 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms