Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRM2P04554 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRM2P04554 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRM2P04554 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRM2P04554 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRM2P04554 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRM2P04554 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRM2P04554 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRM2P04554 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRM2P04554 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRM2P04554 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRM2P04554 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRM2P04554 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRM2P04554 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRM2P04554 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRM2P04554 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRM2P04554 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRM2P04554 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRM2P04554 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRM2P04554 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRM2P04554 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRM2P04554 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRM2P04554 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRM2P04554 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRM2P04554 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRM2P04554 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRM2P04554 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRM2P04554 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRM2P04554 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRM2P04554 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRM2P04554 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRM2P04554 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRM2P04554 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRM2P04554 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRM2P04554 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRM2P04554 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRM2P04554 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRM2P04554 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRM2P04554 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRM2P04554 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms