Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC3P02656 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC3P02656 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC3P02656 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC3P02656 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC3P02656 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC3P02656 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC3P02656 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC3P02656 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC3P02656 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC3P02656 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC3P02656 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC3P02656 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC3P02656 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC3P02656 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC3P02656 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC3P02656 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC3P02656 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC3P02656 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC3P02656 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC3P02656 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC3P02656 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC3P02656 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC3P02656 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC3P02656 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC3P02656 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC3P02656 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC3P02656 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC3P02656 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOC3P02656 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC3P02656 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC3P02656 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC3P02656 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC3P02656 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOC3P02656 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC3P02656 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC3P02656 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC3P02656 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC3P02656 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC3P02656 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC3P02656 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC3P02656 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC3P02656 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC3P02656 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC3P02656 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC3P02656 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC3P02656 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC3P02656 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC3P02656 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC3P02656 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC3P02656 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC3P02656 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOC3P02656 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOC3P02656 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOC3P02656 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOC3P02656 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC3P02656 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC3P02656 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC3P02656 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC3P02656 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC3P02656 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC3P02656 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC3P02656 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms