Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-33P01772 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-33P01772 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms