Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRP01130 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRP01130 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRP01130 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRP01130 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRP01130 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRP01130 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRP01130 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRP01130 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRP01130 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRP01130 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRP01130 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRP01130 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRP01130 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRP01130 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRP01130 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRP01130 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRP01130 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRP01130 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRP01130 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRP01130 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRP01130 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRP01130 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LDLRP01130 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LDLRP01130 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRP01130 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRP01130 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRP01130 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRP01130 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRP01130 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRP01130 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRP01130 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRP01130 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRP01130 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRP01130 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRP01130 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRP01130 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRP01130 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRP01130 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRP01130 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRP01130 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRP01130 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRP01130 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRP01130 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRP01130 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRP01130 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDLRP01130 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LDLRP01130 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRP01130 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRP01130 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LDLRP01130 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms