Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX7O95931 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX7O95931 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX7O95931 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX7O95931 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX7O95931 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX7O95931 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX7O95931 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX7O95931 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX7O95931 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBX7O95931 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX7O95931 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX7O95931 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX7O95931 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX7O95931 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX7O95931 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX7O95931 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX7O95931 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX7O95931 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX7O95931 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX7O95931 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBX7O95931 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX7O95931 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX7O95931 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX7O95931 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX7O95931 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX7O95931 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX7O95931 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX7O95931 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX7O95931 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CBX7O95931 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX7O95931 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX7O95931 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX7O95931 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX7O95931 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX7O95931 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX7O95931 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX7O95931 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX7O95931 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX7O95931 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX7O95931 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBX7O95931 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX7O95931 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX7O95931 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBX7O95931 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX7O95931 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX7O95931 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX7O95931 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX7O95931 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX7O95931 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX7O95931 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX7O95931 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX7O95931 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX7O95931 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX7O95931 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX7O95931 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX7O95931 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX7O95931 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX7O95931 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX7O95931 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX7O95931 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX7O95931 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX7O95931 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX7O95931 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX7O95931 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX7O95931 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX7O95931 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX7O95931 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX7O95931 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX7O95931 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX7O95931 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX7O95931 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX7O95931 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX7O95931 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX7O95931 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX7O95931 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX7O95931 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX7O95931 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX7O95931 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX7O95931 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX7O95931 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX7O95931 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX7O95931 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX7O95931 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX7O95931 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX7O95931 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX7O95931 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX7O95931 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX7O95931 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms