Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNDBP1O95273 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1O95273 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNDBP1O95273 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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