Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATE1O95260 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATE1O95260 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATE1O95260 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATE1O95260 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATE1O95260 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATE1O95260 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATE1O95260 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATE1O95260 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATE1O95260 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATE1O95260 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATE1O95260 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATE1O95260 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATE1O95260 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATE1O95260 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATE1O95260 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATE1O95260 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATE1O95260 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATE1O95260 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATE1O95260 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATE1O95260 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATE1O95260 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATE1O95260 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATE1O95260 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATE1O95260 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATE1O95260 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATE1O95260 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATE1O95260 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATE1O95260 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATE1O95260 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATE1O95260 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATE1O95260 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATE1O95260 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATE1O95260 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATE1O95260 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATE1O95260 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATE1O95260 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATE1O95260 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATE1O95260 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATE1O95260 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATE1O95260 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATE1O95260 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATE1O95260 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATE1O95260 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATE1O95260 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATE1O95260 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATE1O95260 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATE1O95260 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATE1O95260 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATE1O95260 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATE1O95260 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATE1O95260 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATE1O95260 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms