Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH8O95206 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH8O95206 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH8O95206 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH8O95206 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH8O95206 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH8O95206 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH8O95206 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH8O95206 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH8O95206 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH8O95206 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms