Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT34O76011 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT34O76011 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT34O76011 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT34O76011 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT34O76011 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT34O76011 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT34O76011 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT34O76011 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT34O76011 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT34O76011 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT34O76011 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT34O76011 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT34O76011 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT34O76011 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT34O76011 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT34O76011 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT34O76011 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT34O76011 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT34O76011 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT34O76011 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT34O76011 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT34O76011 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT34O76011 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT34O76011 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT34O76011 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT34O76011 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT34O76011 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT34O76011 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT34O76011 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT34O76011 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT34O76011 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT34O76011 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT34O76011 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT34O76011 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT34O76011 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT34O76011 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT34O76011 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT34O76011 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT34O76011 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT34O76011 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT34O76011 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT34O76011 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT34O76011 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT34O76011 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT34O76011 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT34O76011 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT34O76011 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT34O76011 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT34O76011 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT34O76011 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT34O76011 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT34O76011 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT34O76011 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT34O76011 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT34O76011 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT34O76011 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT34O76011 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT34O76011 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms