Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNKO75909 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNKO75909 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNKO75909 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNKO75909 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNKO75909 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNKO75909 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNKO75909 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNKO75909 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNKO75909 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNKO75909 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNKO75909 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNKO75909 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNKO75909 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNKO75909 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNKO75909 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNKO75909 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCNKO75909 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCNKO75909 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCNKO75909 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCNKO75909 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNKO75909 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNKO75909 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNKO75909 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNKO75909 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNKO75909 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNKO75909 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNKO75909 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNKO75909 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCNKO75909 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNKO75909 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNKO75909 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNKO75909 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNKO75909 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNKO75909 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNKO75909 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCNKO75909 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCNKO75909 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCNKO75909 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCNKO75909 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCNKO75909 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNKO75909 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNKO75909 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNKO75909 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNKO75909 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNKO75909 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNKO75909 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNKO75909 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCNKO75909 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms