Protein–RNA interactions for Protein: O75838

CIB2, Calcium and integrin-binding family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2O75838 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB2O75838 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB2O75838 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB2O75838 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB2O75838 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB2O75838 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB2O75838 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB2O75838 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB2O75838 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB2O75838 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB2O75838 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB2O75838 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB2O75838 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB2O75838 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB2O75838 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB2O75838 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB2O75838 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB2O75838 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB2O75838 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB2O75838 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB2O75838 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB2O75838 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB2O75838 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB2O75838 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB2O75838 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB2O75838 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB2O75838 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB2O75838 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB2O75838 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB2O75838 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB2O75838 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB2O75838 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB2O75838 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB2O75838 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB2O75838 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB2O75838 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB2O75838 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CIB2O75838 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CIB2O75838 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CIB2O75838 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CIB2O75838 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB2O75838 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB2O75838 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB2O75838 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB2O75838 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB2O75838 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB2O75838 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB2O75838 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB2O75838 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB2O75838 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB2O75838 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB2O75838 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB2O75838 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB2O75838 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB2O75838 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB2O75838 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB2O75838 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB2O75838 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB2O75838 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB2O75838 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB2O75838 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB2O75838 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB2O75838 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms