Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCATO75600 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCATO75600 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCATO75600 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCATO75600 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCATO75600 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCATO75600 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCATO75600 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCATO75600 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCATO75600 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCATO75600 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCATO75600 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCATO75600 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCATO75600 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCATO75600 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCATO75600 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCATO75600 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCATO75600 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCATO75600 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCATO75600 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCATO75600 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCATO75600 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCATO75600 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCATO75600 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCATO75600 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GCATO75600 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCATO75600 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCATO75600 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCATO75600 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCATO75600 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCATO75600 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCATO75600 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCATO75600 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCATO75600 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCATO75600 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCATO75600 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCATO75600 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCATO75600 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCATO75600 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCATO75600 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCATO75600 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCATO75600 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCATO75600 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCATO75600 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCATO75600 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCATO75600 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCATO75600 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCATO75600 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCATO75600 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCATO75600 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCATO75600 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCATO75600 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCATO75600 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCATO75600 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCATO75600 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCATO75600 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms