Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKAP2O75563 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP2O75563 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKAP2O75563 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms