Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX3O75364 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX3O75364 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX3O75364 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX3O75364 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX3O75364 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX3O75364 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX3O75364 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX3O75364 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX3O75364 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX3O75364 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX3O75364 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX3O75364 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX3O75364 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX3O75364 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX3O75364 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX3O75364 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX3O75364 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX3O75364 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX3O75364 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX3O75364 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX3O75364 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX3O75364 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX3O75364 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX3O75364 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX3O75364 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX3O75364 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX3O75364 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX3O75364 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX3O75364 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX3O75364 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX3O75364 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX3O75364 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PITX3O75364 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PITX3O75364 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PITX3O75364 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX3O75364 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX3O75364 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX3O75364 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX3O75364 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX3O75364 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX3O75364 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PITX3O75364 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITX3O75364 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms