Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2O75044 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2O75044 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2O75044 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms