Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF5BO60841 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms