Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC22O60826 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC22O60826 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC22O60826 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms