Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL41O60662 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms