Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KIF1CO43896 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF1CO43896 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms