Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYNGR3O43761 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYNGR3O43761 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms