Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN4O43707 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTN4O43707 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms