Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3O43617 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3O43617 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC3O43617 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms