Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TREHO43280 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TREHO43280 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TREHO43280 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TREHO43280 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TREHO43280 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TREHO43280 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TREHO43280 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TREHO43280 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TREHO43280 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TREHO43280 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TREHO43280 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TREHO43280 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TREHO43280 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TREHO43280 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREHO43280 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREHO43280 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREHO43280 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREHO43280 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREHO43280 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREHO43280 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREHO43280 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREHO43280 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREHO43280 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREHO43280 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREHO43280 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREHO43280 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREHO43280 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREHO43280 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREHO43280 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREHO43280 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREHO43280 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREHO43280 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREHO43280 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREHO43280 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREHO43280 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREHO43280 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TREHO43280 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TREHO43280 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TREHO43280 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TREHO43280 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TREHO43280 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TREHO43280 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TREHO43280 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TREHO43280 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREHO43280 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREHO43280 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREHO43280 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREHO43280 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREHO43280 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREHO43280 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREHO43280 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREHO43280 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREHO43280 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TREHO43280 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TREHO43280 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TREHO43280 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TREHO43280 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TREHO43280 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TREHO43280 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TREHO43280 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TREHO43280 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TREHO43280 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TREHO43280 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TREHO43280 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TREHO43280 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TREHO43280 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TREHO43280 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TREHO43280 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TREHO43280 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TREHO43280 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TREHO43280 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TREHO43280 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TREHO43280 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TREHO43280 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TREHO43280 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TREHO43280 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TREHO43280 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TREHO43280 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TREHO43280 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TREHO43280 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TREHO43280 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TREHO43280 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TREHO43280 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TREHO43280 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TREHO43280 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TREHO43280 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TREHO43280 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TREHO43280 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms