Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 CAMTA1-211ENST00000482934 743 ntTSL 310.01□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 CAMTA1-204ENST00000467267 664 ntTSL 37.45□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 CAMTA1-206ENST00000470648 766 ntTSL 37.28□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 CAMTA1-203ENST00000461580 826 ntTSL 35.66□□□□□ -1.54e-6■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 CAMTA1-202ENST00000461311 431 ntTSL 23.61□□□□□ -1.834e-6■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 A2M-211ENST00000543436 600 ntTSL 58.64□□□□□ -1.033e-14■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 A2M-212ENST00000545828 471 ntTSL 44.08□□□□□ -1.763e-14■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 ABLIM1-204ENST00000369256 3203 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.929e-9■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 ABLIM1-201ENST00000277895 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.959e-9■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 ABLIM1-203ENST00000369253 2255 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.029e-9■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 ABLIM1-208ENST00000428430 854 ntTSL 38.05□□□□□ -1.129e-9■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 ABLIM1-205ENST00000369266 2230 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.269e-9■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 ABLIM1-209ENST00000440467 541 ntTSL 34.36□□□□□ -1.719e-9■■■■■ 33.4
RBFOX2O43251 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.217e-7■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 GALNS-209ENST00000567525 1953 ntTSL 212.18□□□□□ -0.467e-7■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 GALNS-212ENST00000568613 1804 ntTSL 210.14□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-206ENST00000553529 562 ntTSL 413.8□□□□□ -0.25e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-231ENST00000557433 1904 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.245e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.245e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.415e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-226ENST00000556825 2215 ntTSL 1 (best)12.15□□□□□ -0.465e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-204ENST00000553324 566 ntTSL 411.92□□□□□ -0.55e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-210ENST00000553950 584 ntTSL 211.77□□□□□ -0.535e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.65e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-222ENST00000555774 2311 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.615e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-217ENST00000555116 1885 ntTSL 211.12□□□□□ -0.635e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-235ENST00000557740 569 ntTSL 411.07□□□□□ -0.645e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-234ENST00000557703 542 ntTSL 410.89□□□□□ -0.675e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.685e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-228ENST00000557302 457 ntTSL 310.68□□□□□ -0.75e-15■■■■■ 33.3
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RBFOX2O43251 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.765e-15■■■■■ 33.3
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RBFOX2O43251 SHMT2-207ENST00000553837 2152 ntTSL 510.16□□□□□ -0.785e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-211ENST00000554310 579 ntTSL 410.12□□□□□ -0.795e-15■■■■■ 33.3
RBFOX2O43251 SHMT2-221ENST00000555773 600 ntTSL 210.02□□□□□ -0.815e-15■■■■■ 33.3
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RBFOX2O43251 SHMT2-209ENST00000553949 552 ntTSL 39.76□□□□□ -0.855e-15■■■■■ 33.3
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RBFOX2O43251 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.331e-9■■■■■ 33.2
RBFOX2O43251 NAE1-216ENST00000566663 576 ntTSL 31.73□□□□□ -2.133e-18■■■■■ 33.2
RBFOX2O43251 CSNK1D-206ENST00000577578 928 ntTSL 29.54□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 33.1
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RBFOX2O43251 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 33.1
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RBFOX2O43251 APEH-214ENST00000482301 1041 ntTSL 310.96□□□□□ -0.651e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 APEH-204ENST00000446089 855 ntTSL 510.83□□□□□ -0.681e-9■■■■■ 33.1
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RBFOX2O43251 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.691e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.711e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 KLC4-207ENST00000463063 841 ntTSL 310.55□□□□□ -0.721e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 CNKSR1-211ENST00000528001 553 ntTSL 410.35□□□□□ -0.751e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 CNKSR1-210ENST00000525687 1200 ntTSL 210.19□□□□□ -0.781e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 MCPH1-207ENST00000522905 2049 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 KLC4-215ENST00000479388 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.851e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 APEH-212ENST00000469362 830 ntTSL 38.87□□□□□ -0.991e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 KLC4-209ENST00000467906 3604 ntTSL 28.21□□□□□ -1.11e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 MCPH1-203ENST00000519480 2917 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.121e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.371e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 CLCN3-208ENST00000512813 563 ntTSL 46.09□□□□□ -1.431e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.451e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.461e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 CLCN3-206ENST00000507875 2485 ntTSL 25.63□□□□□ -1.511e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.611e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 CLCN3-207ENST00000511092 582 ntTSL 34.34□□□□□ -1.711e-9■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-220ENST00000560654 784 ntTSL 59.9□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-216ENST00000560031 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-212ENST00000559454 1768 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-202ENST00000396509 1834 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-215ENST00000559963 794 ntTSL 28.41□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-217ENST00000560119 2053 ntTSL 28.1□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-211ENST00000559423 895 ntTSL 57.81□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 33.1
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