Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRXO43186 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CRXO43186 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRXO43186 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRXO43186 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CRXO43186 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRXO43186 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRXO43186 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRXO43186 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRXO43186 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRXO43186 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRXO43186 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRXO43186 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms