Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP26A1O43174 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP26A1O43174 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP26A1O43174 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP26A1O43174 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP26A1O43174 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP26A1O43174 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms